Garant předmětu:
doc. RNDr. Milan Urban, Ph.D.
Způsob zakončení:
Zkouška
Stručná anotace předmětu:
Předmět je zaměřen na chemické reakce v živých organizmech a na možnosti, jak pomocí malých organických molekul ovlivňovat (negativně i pozitivně), monitorovat nebo mimikovat biologické procesy. Bude kladen důraz zejména na sloučeniny potenciálně využitelné k diagnostice a látky s možným terapeutickým efektem bez ohledu na to, zda jsou v současnosti využívané nebo ne, dále budou diskutovány trendy do budoucnosti.
Sylabus:
- Stručný úvod do molekulární biologie – DNA, RNA, proteiny, epigenetika, buněčný cyklus, buněčná signalizace.
- Fyzikální interakce molekul v živých organizmech, vazba substrát-enzym, ligand-receptor, léčivo-cíl, protein-proteinové interakce, biomembrány atd.
- Design molekul, které do těchto interakcí vstupují a vztah mezi vazebnou energií a aktivitou.
- Design molekul, které mimikují nukleové kyseliny a proteiny a molekul, které ovlivňují genovou expresi.
- Základní laboratorní techniky používané v molekulární medicíně – izolace, purifikace a charakterizace nukleových kyselin a proteinů, analýzy genové exprese, fluorescenční reportérové assaye.
- Přehled nejběžnějších fluorescenčních molekul využívaných v biologických experimentech.
- Osud xenobiotik v živém organizmu, adsorpce, transportní mechanizmy, metabolické přeměny, vylučování.
- Chemické modifikace malých molekul za účelem změny jejich chování v biologickém systému.
Odborná literatura:
- Van Vrankern, D.; Weiss, G. Introduction to Bioorganic Chemistry and Chemical Biology. 2013.
Ondřej Slabý et al. Molekulární medicína, Galén, 2015 - Nelson, D. L., Cox, M. M. Lehninger Principles of Biochemistry 6th edition, Macmillan
- Alberts B., Molecular Biology of Cell, 6th edition, Garland Publishing, 2015.