Katedra organické chemie působí na dvou pracovištích v Olomouci. Tradičně je součástí Přírodovědecké fakulty Univerzity Palackého v Olomouci. Od roku 2010 se v rámci výzkumné a pedagogické spolupráce s Lékařskou fakultou UP stala součástí Ústavu molekulární a translační medicíny nacházející se v areálu Fakultní nemocnice v Olomouci.