Katedra organické chemie tradičně působí v budově Přírodovědecké fakulty ve vysokoškolském areálu Envelopa v Olomouci. V bezprostřední blízkosti se nachází koleje a menza. Historické centrum města je dostupné 15 minut pěší chůzí a docházkovou vzdáleností je přístupné i hlavní nádraží města Olomouce.