Katedra organické chemie PřF UP dlouhodobě spolupracuje s řadou zahraničních univerzit a institucí. Vzájemná kooperace poskytla již řadu významných grantů, vědeckých publikací či patentů a potvrdila naši konkurenceschopnost a uplatnění v celosvětovém měřítku.
IMC University of Applied Sciences Krems (Rakousko): Department of Science and Technology
Spolupráce s IMC University of Aplied Science v Rakousku vznikla na základě výzkumných Ph.D. stáží pod vedením pprof. Uwe Rinnera. Jeho oblastí zájmu je řada témat organické chemie, od syntézy biologicky aktivních sloučenin až po výrobu funkčních prepolymerů a vývoj nových metod syntézy. Ústav také využívá biotechnologické postupy k výrobě výchozích látek pro výrobu vysoce funkcionalizovaných produktů. Tyto fermentační procesy přeměňují aromatické sloučeniny na odpovídající cyklohexandioly, které jsou cennými chirálními složkami pro projekty syntézy.
Vrije Universiteit Brussel (VUB), Belgium – Department of Chemistry
Spolupráce s Vrije Universiteit Brussel byla navázána s prof. Frank De Proft a F. De Vleeschouwer. Nejprve jsme se zaměřili na společný výzkum v oblasti DFT a ab initio kalkulací radikálů s hlavním zaměřením na oxido-redukční vlastnosti rostlinných sekundárních metabolitů fenylpropanoidového typu. V současné době se pak zaměřujeme zejména na kombinovaný teoreticko (DFT) experimentální (určení pomocí fyzikálních metod) přístup umožňující predikci pKa hodnot nově připravených Hydrogen-bond donorů vhodných pro organokatalytické reakce.
Seznam publikací ve spolupráci KOCH s Frank De Proft
Seznam publikací ve spolupráci KOCH s De Vleeschouwer
University of Notre Dame (IN, USA): Department of Chemistry and Biochemistry
Spolupráce s Notre Dame Univerzitou, Katedrou chemie a biochemie byla zahájena v roce 2007 s prof. Viktorem Krchňákem specialistou na kombinatoriální chemii, zejména však na syntézu na pevné fázi. Řada studentů i zaměstnanců z Katedry organické chemie Univerzity Palackého absolvovala výzkumné stáže v jeho výzkumné skupině s cílem získat dovednosti a znalosti z oblasti syntézy na pevné fázi a kombinatoriální chemie. V současné době se věnuje dvěma výzkumným tématům. První z nich je věnovaný vývoji syntetických cest k zisku diverzních chirálních heterocyklických sloučenin s 3D architekturou a úplnou kontrolou stereochemie, která strukturálně napodobuje komplexní přírodní látky a obsahuje připojené/přemostěné střední i velké kruhy. Druhý projekt je zaměřen na solid-phase syntézu diverzních dusíkatých sloučenin kvalifikovaných jako privilegované struktury. Klíčovou transformací je přesun aryl skupiny pomocí intramolekulární arylace pokročilých intermediátů vázaných na pevném nosiči, které obsahují 2-nitrobenzensulfonamidovou část. 
Později byla spolupráce rozšířena i ve výzkumné skupině prof. Shahriar Mobashery. Jeho ústředním tématem výzkumu je studium rezistence antibiotik a vývoj antibiotik nových. V rámci spolupráce byla studována efektivní syntéza alkenů pomocí Wittigovy reakce s využitím uhličitanu střibrného či regioselektivita aminace na 5-substituovaném 2,4-dichloropyrimidinu využívající terciární aminy jako nukleofily. 
Významná kooperace byla navázána i s dalším světovým specialistou na vývoj a výzkum nových antibiotik prof. Marvinem J. Millerem. Dlouhodobé téma jeho výzkumné skupiny je studium regioselektivní hetero Diels-Alderovy reakce arylnitroso sloučenin vedoucí k derivátům oxazinů se současnou chirální analýzou cílových sloučenin.
Seznam publikací ve spolupráci s KOCH Viktor Krchňák
Seznam publikací ve spolupráci KOCH Shahriar Mobashery
Seznam publikací ve spolupráci KOCH Marvin J. Miller
Jagiellonian University Kraków (Polsko): Faculty of Pharmacy
Spolupráce s Jagellonskou Univerzitou byla zahájena v roce 2014 a je zaměřena na syntézu a studium nových ligandů vybraných molekulárních cílů. V současné době je výzkum zaměřen dvěma směry. Prvním z nich je hledání a vývoj látek s agonistickým/antagonistickým účinkem na vybrané serotoninové receptory. Druhá oblast je směřována na vývoj duálních inhibitorů vybraných fosfodiesteráz. Klíčovým spolupracovníkem v obou směrech je doc. Pawel Zajdel. Společným jmenovatelem je hledání potenciálních léčiv neurodegenerativních onemocnění, ale také identifikace látek s účinky protizánětlivými a antidepresivními. V případě derivátů působících na centrální nervovou soustavu se aktuálně podařilo vybrané ligandy serotoninových receptorů ochránit celosvětovým patentem. Zmíněné deriváty jsou nyní předmětem pokročilých preklinických studií.
Seznam publikací ve spolupráci s KOCH Pawel Zajdel
Johannes Kepler University, Austria – Institute of Organic Chemistry
Spolupráce s JKU je navázána s prof. Mario Waserem a jeho výzkumnou skupinu v oblasti organokatalýzy, zejména pak v oblasti vývoje nových PTC (phase-transfer katalyzátor). Hlavní důraz je kladen na vývoj a design nových katalyzátorů a reakcí.
Seznam publikací ve spolupráci s KOCH Mario Waser
Indiana University – Purdue University Indianapolis (IN, USA): Department of Chemistry and Chemical Biology
Spolupráce s prof. Williamem L. Scottem z Oddělení chemie a chemické biologie byla navázána roku 2012 na základě série zvaných přednášek pro studenty i zaměstnace Přírodovědecké fakulty UP. Ve své výzkumné činnosti si zakládá na systematickém začlenění studentů do oblasti vývoje léčiv. Jeho strategie je založena na mezinárodním D3 (Distributed Drug Discovery) projektu, na který byly v minulosti přijaty i naše dvě studentky. Strategie D3 projektu je založena na jednoduché syntéze nových sloučenin za použití levného vybavení a jejich následného biologického screeningu v rámci edukačního procesu.
University of Tromsø (Norsko): Institute of Pharmacy
Od roku 2008 katedra organické chemie spolupracuje s prof. Natasou Skalko-Basnet z Katedry Farmacie Univerzity Tromsø v Norsku. Výzkumná kooperace vznikla na základě společného EEA grantu zaměřeného na zvyšování biodostupnosti slabě rozpustných nových biologicky aktivních látek. V rámci spolupráce vznikla studie na zvyšování rozpustnosti a stability derivátů 3-hydroxychinolin-4(1H)-onů se slibnou cytostatickou a kancerostatickou aktivitou.
Seznam publikací ve spolupráci s KOCH Natasa Skalko-Basnet
University of Southern Denmark (Dánsko): Department of Physics and Chemistry
Spolupráce s Univerzitou of Southern Denmark probíhá jak ve vědecké tak edukativní rovině v rámci programu Erasmus+. Naším partnerem je prof. Poul Nielsen, jehož výzkumná skupina se dlouhodobě zabývá syntézou a aplikací modifikovaných oligonukleotidů (DNA-analogů). Jedním z výzkumných témat jsou C-rozvětvené oligonukleotidy a konformačně omezené DNA analoga jako např. nedávno objevená LNA (Locked Nucleic Acid), která ve srovnání s doposud známými DNA analogy vykazuje bezprecedentní vazebnou afinitu ke komplementární DNA a RNA. Mezi další studované oblasti patří modelování derivátů nukleových kyselin a cílových RNA sekundárních struktur, dále syntéza a biologická studie malých molekul jako jsou nukleosidy, nukleotidy a DNA/RNA intercalátory a jejich konjugované analoga.
Seznam publikací ve spolupráci s KOCH Poul Nielsen
University of the Sunshine Coast (Australia): Faculty of Science, Health, Education and Engineering
Prof. John Bartlett z Univerzity Sunshine Coast z Austrálie (USC) navštívil v roce 2013 Katedru organické chemie s přednáškou o nanočásticích oxidu křemičitého určených k transportu léčiv a zahájil tak vzájemnou spolupráci našich pracovišť. Jeho specializace mimo jiné patří „sol-gel“ chemie pro syntézu nanostrukturních materiálů, zejména při teplotách kompatibilních s polymerními a biologickými substráty. Během kooperace jsou vyvíjeny vhodné silikátové nanomateriály určené k přenosu látek syntetizovaných na našem pracovišti v Olomouci.
Seznam publikací ve spolupráci s KOCH John Bartlett
Université catholique de Louvain, Belgium – Institute of Condensed Matter and Nanosciences
Ve spolupráci s prof. Raphaël Robiette probíhá výzkum Julieovy reakce. Úspěšně byla publikována studie E/Z selektivity Julia olefinace na aromatických aldehydech. V současnosti v kooperaci vzniká projekt DFT výpočtů zaměřený na mechanistickou studii modifikované Julieovy reakce a příbuzných olefinačních protokolů.