Katedra organické chemie » Detail publikace

Detail publikace

Autor: Přibylka, A.; Krchňák, V.
Název práce v češtině: Syntéza 3,4-dihydropyrazin-2(1H)-onů na pevné fázi za katalýzy zlatem: relevantní farmakofory a konformační omezení v peptidovém řetězci
Název práce v angličtině: Gold-Catalyzed Solid-Phase Synthesis of 3,4-Dihydropyrazin-2(1H)-ones: Relevant Pharmacophores and Peptide Backbone Constraints
Studentská publikace: ne
Klíčová slova v češtině: 3,4-dihydropyrazin-2(1H)-ony; katalýza zlatem; peptidomimetika; syntéza na pevné fázi
Klíčová slova v angličtině: 3,4-dihydropyrazin-2(1H)-ones; gold catalysis; peptidomimetics; solid-phase synthesis
Abstrakt česky: Popisujeme efektivní syntézu N-propargyl peptidů na pevné fázi s použitím Fmoc-amino kyselin a propargyl alkoholu jako klíčových výchozích látek. Zlatem katalyzovaná nukleofilní adice na trojnou vazbu vyvolala tvorbu vazby C-N, což spustilo intramolekulární cyklizaci vedoucí k 1,3,4-trisubstituovaným 5-methyl-3,4-dihydropyrazin-2(1H)-onům. Konformace acyklických peptidů a peptidů s konformačním omezením byly srovnány s použitím dvou krokové konformační distribuční analýzy na úrovni molekulové mechaniky a „density functional theory“. Výsledky ukázaly, že inkorporace heterocyklických molekulárních skafoldů do krátké peptidové sekvence přijala rozšířenou konformaci peptidového řetězce. Amidická vazba přiléhající k vazbě nevykazuje významnou preferenci pro cis nebo trans isomerismus. Připravené modelové sloučeniny demonstrují ověření konceptu zlatem katalyzované syntézy různě substituovaných 3,4-dihydropyrazin-2(1H)-onů na pevné fázi pro využití ve výzkumu léčiv a jako konformační omezení peptidového řetězce.
Abstrakt anglicky: Here, we report the efficient solid-phase synthesis of N-propargyl peptides using Fmoc-amino acids and propargyl alcohol as key building blocks. Gold-catalyzed nucleophilic addition to the triple bond induced C-N bond formation, which triggered intramolecular cyclization, yielding 1,3,4-trisubstituted-5-methyl-3,4-dihydropyrazin-2(1H)-ones. Conformations of acyclic and constrained peptides were compared using a two-step conformer distribution analysis at the molecular mechanics level and density functional theory. The results indicated that the incorporation of heterocyclic molecular scaffold into a short peptide sequence adopted extended conformation of peptide chain. The amide bond adjacent to the constraint did not show significant preference for either cis or trans isomerism. Prepared model compounds demonstrate a proof of concept for gold-catalyzed polymer-supported synthesis of variously substituted 3,4-dihydropyrazin-2(1H)-ones for applications in drug discovery and peptide backbone constraints.
Jazyk v originále: angličtina
Název časopisu: ACS Comb. Sci.
Rok: 2017
Svazek (ročník): 19
Číslo časopisu v rámci uvedeného svazku: 11
Strana od-do: 681-686

Q1: ne

ISSN časopisu: 2156-8944
Vydavatel: American Chemical Society
Způsob financování: 16-06446S (GAČR)
DOI: 10.1021/acscombsci.7b00117