Katedra organické chemie garantuje bakalářský studijní program Bioorganická chemie a chemická biologie, na který po absolvování navazuje magisterský program stejného názvu Bioorganická chemie a chemická biologie. Program je určen studentům, kteří mají zájem o širší studium chemie se zaměřením na sloučeniny s biologickou aktivitou a potenciální aplikací v medicíně.
Tradičně také garantujeme navazující program Organická chemie, jehož obsahem je syntéza nových organických sloučenin, určování jejich struktury a vztahu mezi strukturou a reaktivitou, dále se zabývá poznáním principů a mechanismů chemických dějů, přípravou nových organických molekul s požadovanými vlastnostmi pro praktické využití a jejich aplikovatelností zejména s výstupem do farmacie, biologie, chemie polymerů a chemie nových materiálů.
